ダウンロードしたクライアント証明書は、PC画面の左下「ここに入力して検索」箇所で下記のクライアント証明書ファイル名を検索することで見つけることができます。
※検索ボックスが表示されていない場合は、タスクバーで右クリックし「検索＞検索ボックスを表示」をクリックすると表示されます。

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(ファイル名)　 　　 synergy○○○○○_****0331.p12
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※○○○○○にはSynergy!へログインする際のユーザIDの上5桁が入り、****には西暦4桁が入ります。拡張子を表示させない設定の場合、「.P12」は表示されません。

アイコンは封筒に鍵のついた以下のようなマークです。
たとえば証明書の有効期限が2014年の3月31日の場合、下記のように表示されます。

※ダウンロード直後はダウンロードフォルダに保存されている可能性が高いです。